さくらのVPSをメールサーバーにするよりさくらのメールボックスを利用したほうが簡単なのでその方法。
環境
ドメイン管理：お名前ドットコム
web サーバー：さくらインターネット（運用中）
メールサーバー：さくらインターネット（追加）
やること
ゾーンのMXを設定
１．さくらインターネットのネームサーバーで、ゾーンのMXを設定する。
以下のページからさくらのメールボックスのアカウントでログインして、ドメインを追加することで設定できる。
ただし、すでにサイトを運営中で、ゾーンに Aレコードが登録されている場合、「DNSゾーンが既に登録されています」というエラーが出る。この場合、さくらのVPSのサーバーコントロールからいったん「ゾーン削除」を行う。再度さくらのメールボックス側からドメインの追加を行うと登録できるので、その後、さくらのVPS側から Aレコードを運営サーバーの IPアドレスに書き換える。
メールの受信やwebメールへのログインができない
さくらのメールボックスでドメインの登録をしてネームサーバーの MXの項目が設定されてもメールの受信や webメールへのログインができなかった。丸二日経っても駄目。
再度設定をネームサーバーの設定を見直すと、さくらのメールボックスへのドメイン登録時に設定された MXの設定が設定前の情報に再変更されていた。再度 MXの情報をメールボックスのドメインに設定したら問題は解決した。
推測だが、問題が起こった原因は、メールボックスにドメインを登録する際、すでに運用中の VPSサーバーの情報をいったんネームサーバーから削除して、すぐメールサーバーからドメインを登録（自動的にネームサーバーも書き換わる）をしたが、ネームサーバーの削除と登録の時間が短かったため、行き違いが起こったと思われる。ネームサーバーの削除と再登録は二時間ほど間を開けた方がいい。
参考ページ
さくらのVPS-さくらのメールボックスでウェブサイトと同じドメインを使う
さくらのナレッジ
メールの作成は、さくらのサーバーコントロールパネルから行う
メールアドレスの作成・変更・削除
